Perteneciente a la Facultad de Ciencias Agrícolas y Forestales de la Universidad Autónoma Juan Misael Saracho (UAJMS) se dedica a desarrollar y fortalecer las capacidades investigativas de estudiantes y docentes, integrando la docencia, investigación y extensión para abordar los problemas ambientales y ecológicos de la región y el país. 

Fundado en 1996, el IIEMA es una dependencia de la Facultad de Ciencias Agrícolas y Forestales, y está dirigido por Linder Espinoza. Con el compromiso de ofrecer un soporte teórico y tecnológico a la problemática regional y nacional del manejo de los recursos naturales, el instituto elabora, gestiona y ejecuta programas y proyectos de investigación significativos.

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